2071 yılında insanlık, Aragami adlı, normal silahlara dayanıklı canavarlar tarafından nesli tükenme tehlikesi ile karşı karşıya. Bu canavarları durdurmak isteyen insanlık alemi, fenrir adlı bir yapı kurmuştur. Bu yapı, Aragamilerle savaşmak için God Arc adında silahlar yapmıştır. Bu silahları God Eaterlar kullanmaktadır. Ana karakter Lenka Utsugi de bir God Eater’dır ama Aragamileri yok etmek için önünde uzun ve birçok şey öğreneceği bir yol vardır önünde.
